Общее собрание акционеров является высшим органом управления Общества.
В соответствии со статьей 11 Устава АО «Загорская ГАЭС-2» в период владения ПАО «РусГидро» 100 процентами голосующих акций Общества решения по вопросам, отнесенным к компетенции Общего собрания акционеров, Общества принимаются Правлением ПАО «РусГидро».
Размер уставного капитала АО «Загорская ГАЭС-2» составляет 62 681 508 646 (Шестьдесят два миллиарда шестьсот восемьдесят один миллион пятьсот восемь тысяч шестьсот сорок шесть) рублей и состоит из обыкновенных именных акций номинальной стоимостью 1 рубль каждая. Привилегированные акции не размещались.